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网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿软件系统化最先见的疾病症状一种。肾组织机构中CaOx纳米线过呈现饱和状态堆积会造成 肾小管生殖细胞挫伤和凋亡,然后造成 肾结石的建立。短链多余乳酸酸由肠内内生物滤池疾病堆肥合理膳食氯纶形成,不只是在部分区域肠内防线中产生影响,另一方面在软件系统化水平面上也产生核心影响。中仅,丁酸是最丰富的的短链多余乳酸酸,拥有免疫系统控制和免疫系统控制影响,本科研探析丁酸对CaOx肾结石的影响十分内在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医院专家泌尿整形科吴忠专家、周子健博士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲解、周子健搏士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱菌物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了无线网络药剂学学工作,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

短文名字大全:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 潜在客户的单位:华山机构 论述的对象:大鼠、HK-2细胞膜 分组名称数据:较组(Con)、模式组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱提高科技:网站药理学学检查

想法具体流程表

研发后果

实验工作人员要融合大鼠绘图,确认身理生化模式因素和组识病症学染色剂等实验的手段发展丁酸可以下降CaOx绘图大鼠肾CaOx氯化钠晶体的型成和直接影响,纠正CaOx绘图大鼠的炎症病变直接影响和空气氧化的有机物的过重表达爱。因此,丁酸还可促使草酸引导的HK-2人体细胞膜直接影响、空气氧化的应激状态和人体细胞膜凋亡。 为探究性丁酸设备构造和靶遗传遗传什么是染色体网站,学习人群从PubChem获得丁酸和丁酸酯的二维和3D设备构造(图1A)。借助PharmMapper参数库和Uniprot参数库治理 后共筛分出117个丁酸靶遗传遗传什么是染色体供进这一步定性进行讲解。将遗传遗传什么是染色体全部导出STRING参数库,使用PPI网站定性进行讲解。Cytoscape列出了排列顺序的前20的交通核心区站靶遗传遗传什么是染色体的具体网站图,最首要的包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这部分交通核心区站遗传遗传什么是染色体与网站中的某些遗传遗传什么是染色体均展现出相应的业内系性,介绍这部分遗传遗传什么是染色体已经挥发着联合功用。GO和KEGG定性进行讲解证明了丁酸交通核心区站遗传遗传什么是染色体的业内系渠道和生物学工程学功能性(图1C)。交通核心区站遗传遗传什么是染色体最首要的与类固醇缴素回复、被氧化影响应激影响响应回复、灵亲水性氧细胞系对类固醇缴素刺击的响应与对含酸性耐腐蚀有害物质的响应业内。综上上述上述,这部分交通核心区站遗传遗传什么是染色体最首要的参与活动了被氧化影响应激影响响应和对灵亲水性氧的生物学工程响应历程,是肾结石成型长效机制中至关核心的渠道,这得出结论丁酸已经在肾结石中挥发核心功用。

图1| 丁酸结构特征与靶基因组手机网络介绍(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进这一步科学探索丁酸对CaOx肾结石肯定切靶染色体遗传遗传,科学探讨方案工人使用GEO数剧库对GSE73680中身体健康参考与CaOx肾结石用户的染色体遗传遗传差距使用了科学探讨方案。参考组与CaOx结石用户的不错力差距表答染色体遗传遗传(DEGs)检查细则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共淘汰到3783个染色体遗传遗传会发生不错转变 ,之中3379个(89.4%)染色体遗传遗传表答调涨,404个(10.6%)染色体遗传遗传表答再降(图2A)。对DEGs使用聚类分析算法分享,热图显现了前10个被选中DEGs的二维分层次聚类分析算法表现形式(图2B)。最后,科学探讨方案工人依据GeneCards数剧库人工客服电话监定了370个概率与CaOx肾结石关于的染色体遗传遗传,排列前20位的预计染色体遗传遗传举例说明关于性评分标准右图2C如图所示。只为查找丁酸诊疗CaOx肾结石的关键的靶点,科学探讨方案工人将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石关于染色体遗传遗传外理能够半个个Venn图。终究,CYP2C9被认定为丁酸引响CaOx肾结石的未知靶点(图2D)。前者,科学探讨方案工人还使用了丁酸与CYP2C9的大分子连通,CYP2C9的3个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸主动角色,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在借助在线药剂学学預测CYP2C9是丁酸直接影响CaOx肾结石的靶什么是基因后,科研者还实现血细胞系进行实验验证了CYP2C9可降低草酸引诱的HK-2血细胞系的ROS级别、支原体感染伤害和凋亡。

图2| 大部分据库协力阐述估计CYP2C9是丁酸用于CaOx肾结石的靶基因组

的研究结杲

本深入分析率先感觉丁酸在休外和休内均能调控CaOx肾结石三维模型的腐蚀物应激性性和支原体感染问题,接着随后实现网格临床临床药理学挑选有丁酸的影响CaOx肾结石的潜在性靶点——CYP2C9,最好实现组织血细胞实验英文验证CYP2C9在草酸盐引导的HK-2组织血细胞ROS程度、支原体感染问题和凋亡。许多感觉意味着丁酸可能性实现调控CYP2C9来调控CaOx肾结石的腐蚀物应激性性,降低支原体感染问题。这些的时候中拜谱怪物展示 了网格临床临床药理学工艺精准安全服务,除外拜谱怪物可的提升成长期成熟的的基因组组学、血清质组学、代谢转化组学等两组学品牌及工艺精准安全服务,追捧详询咨询了解! 关联性文献综述:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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