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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已屏幕上显示出很广的生态学活力，收录抗癌症和抵抗疾病毒功效。基本，三萜是确认甲羟戊酸方式制作而成的，并从天然水值物和病菌中去除。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上发布了题写“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的探析论文范文。该探析发现三萜类有机化合物灵芝粉粉酸（GA）是能够透明液体培植的无柄灵芝粉粉菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的海洋生物技术转为所生成的。能够转录组和蛋白酶酶质组学技艺切实骤生命的进化无柄虫草菌丝体中DHT所生成不同虫草酸（GA）的管理机制，并会按照几组学技艺的检测到的的性别差异什么是基因和的性别差异蛋白酶酶，猜测DHT 海洋生物技术结合 GA 的渠道。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录类物质析和特点几大类

利用对无柄灵芝粉真菌孢子菌丝体去转录组测序共得见67230个转录本和14295个单遗传DNA。在某些单遗传DNA中，494个被签别为区别传达遗传DNA（DEGs），各举213个传达调涨，279个传达调整（图1A）。GO怪物含有研究后，DEGs可分怪物的具体步骤（BP）、受损细胞膜物质（CC）和分子式功能模块（MF）3类。在BP专业类属中，显示了前四个子专业类属：抗菌素拆分消化吸收的具体步骤，醋酸钠盐消化吸收的具体步骤和甲酸盐消化吸收的具体步骤;而在CC专业类属中，受损细胞膜外区、突触混合体、突触组成部分是前四个亚类。就MF专业类属，甲酸脱氢酶（NAD）几丁质酶、氧化的还原成酶几丁质酶和酸氨（或酰胺）拼接酶几丁质酶是前四个亚专业类属（图1B）。在DEGs的KEGG数据信号径路研究中，前30条怪物含有度比较高的数据信号径路有27条应属消化吸收，各举甲烷气体消化吸收、乙醛酸盐和二羧酸盐消化吸收、丙酸盐消化吸收数据信号数据信号径路相关系数怪物含有（图1D）。

图1|转录酚类化合物析和功能性分类整理

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

使用对无柄野生灵芝念珠菌菌丝体做出球膳食纤维组学浅析，至少决定了16,457种特点肽、2606种球膳食纤维和2588种按量球膳食纤维。在阈值法|FC|>1.2和p<0.05的建立必要条件下，我在这2606种球膳食纤维中，94种被认定为差距展现球血清质含量（DEPs），这之中52种调涨，42种变动（图2A），图2C出现了差距展现球血清质含量的聚类阐述浅析热图。从GO浅析看，BP品类出现，绝大而言数DEPs积极参与乙酸盐分泌操作步骤、抗菌素降解分泌操作步骤和药物剂量降解分泌操作步骤。CC类DEPs在内部外区、过钝化物酶体和微体中总额极高，钝化重置酶生物制品学和甲酸脱氢酶（NAD）生物制品学在MF类中DEPs的此例极高（图2B）。与转录组后果相近，KEGG环路浅析出现，很多的DEPs在分泌中丰度，这之中3条最丰度的渠道是光合生物制品学中的碳加固、碳分泌和MAPK的信号环路（图2D）。虽然，使用浅析GO数据文件库的CC对DEPs做出亚内部精准定位浅析和引用（图2E），DEPs基本匀称在内部质（40.66%）、内部膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），理论与实践上是GAs生物制品学聚合的基本地段。

图2|球蛋白质含量组的按量具体分析和职能认可

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

糊口物转化成和剖析组获选DEGs和DEPs自制了维恩图，有20个不同之处表明dna（图3A）。对转录组和核高淀粉酶组中E组和C组总共的DEGs/DEPs做聚类算法了解一下，看到mRNA和核高淀粉酶两者有1五类上涨dna和五类降低dna，DEGs与此讲述的DEPs表明程度呈正有关系，针对Pearson的有关系标准值了解一下，在转录组和核高淀粉酶组两者判断到相对比较较高的有关系性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）监测报告单屏幕上显示，E组和C组115个DEGs的形容方法情况性别差异不错，这当中9个为调整DEGs，两个为调低DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的形容方法趋势英文与转录类物质析报告单不对。

图3|核脂肪酸组的酶联免疫法研究分析和用途验正

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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