
近日,成都医科学校考研一号附带医院门诊王学浩博士专业团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶点人体脂肪基础代谢检测分析服务。
英语小标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文翻译问题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客人机关单位:南京医科大学
科研板材:细胞
拜谱出具提供服务:转录组测序+核蛋白互作组+靶向疗法能量是什么分解组
科技行车路线:
研究方案毕竟
01、YBX1被检测为HCC中糖酵解的重要性染色体
本钻研采集器HCC肿癌样板(n=7)的单淋巴肺部癌肿体组织RNA测序动态数值集完成探讨,得知糖酵解几丁质酶主耍集中点在肿癌淋巴肺部癌肿体组织中,hdWGCNA探讨认别出9个DNA控制器(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的荒岛我的世界生存探讨断定YBX1为自由荒岛我的世界生存风险存在原因(图1H)。进那步综合IHC、WB实验设计和肿癌集体与紧邻非肿癌集体的面积转录组学动态数值集断定YBX1是肝淋巴肺部癌肿体组织癌进行治疗的潜在的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被制定为设定HCC癌细胞糖酵解的关键影响影响
02、YBX1有利于HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点动能分解组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1增强HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1紧密联系并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1搭配并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增强学习其磷硝化作用,导致利于其核转位
进三步在线检测YBX1的O-GlcNAc糖基化有无引响其磷过酸,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT减弱剂OSMI-1加工,YBX1淀粉酶情况取得缩减,YBX1磷过酸取得减掉(图4A-C)。IP调查展示,在一样的的Flag-YBX1底物情况下,YBX1-WT的磷过酸情况取得大于YBX1-T57A,阐明磷过酸的加入不单仅是而是挺高的YBX1淀粉酶表述(图4D)。提取了核和质成分得知TMG加工的HCC神经元中YBX1核表述的提升(图4E-F),进三步得知YBX1磷过酸的首要调接细胞是AKT(图4G-I)。这类得知认为O-GlcNAc糖基化用使得其磷过酸来改善YBX1淀粉酶增强性并使得核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖有助于其进一部有磷硝化作用掩盖并能够推动其核转位
05、YBX1加快PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1增强PKM2转录
06、YBX1 也能提升组核蛋白乳硝化作用呈现级别
调查出现 YBX1敲低重要减轻蛋清质乳碱化,特别是在是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解宏观调控剂2-DG的實驗得知了糖酵解与组蛋清乳碱化的直观同步,宏观调控糖酵解可重要减轻H3K18la水平面(图6D)。PKM2过展现可逆性转YBX1敲低引起的H3K18la变低,到外源乳酸处置往往升高H3K18la,还随之YBX1展现上浮,表示发生单向信息反馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR得知,H3K18la顺利通过生物富集于YBX1重启子直观促使其转录,该过程中受O-GlcNAc糖基化宏观调控(图6H-J),并出现 P300 上浮是YBX1增強H3K18乳酰化为用的制度(图6K-L)。
图6.YBX1加强H3K18乳过酸掩盖的水平
一篇文章总结
在这样项研发中新闻报导了YBX1在HCC中高表明,但是与糖酵解析切相关的的。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,然而动态平衡球蛋白质并加入其表明。这样种装饰还催进YBX1在T57处的磷碱化,催进其核易位。对此,这样的过程 开展了糖酵解相关的的人类什么是基因的转录并刺激作用乳酸的带来。前者,YBX1提高P300的转录,从根本上win7驱动组球蛋白质的乳碱化,尤其是是H3K18la,H3K18乳碱化正方向调节管控YBX1人类什么是基因转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因遗传规律正负极馈环原则图
拜谱工作小结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱怪物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向治疗电量代谢转化组技术服务,拜谱生物工程建立了完善成熟的转录组学、血清组学、反译后突显组学、分泌组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
关联性专著
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.