
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱动物 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
的研究没想到
学习人士探究性跟随着保温库精力延伸牛羊肉的密度、持来说水力、光泽感度、徘徊于铁成分、ROS、脂质过氧化物质物、MDA、GSH和GPX4力量来开展相关肌肉组织开展肿瘤人体细胞的铁死亡者模式。报告体现,保温库精力延伸后,牛羊肉的密度在第5天和第6天特殊急剧下降;持水力量有效降低;外表颜色变深,失光泽感,鲜色的变成暗色的。凡此种种,徘徊于铁、活力氧和MDA的成分特殊曾加,肿瘤人体细胞凋亡率特殊提高。 探索员工分离出多种冷藏库末期的力量备样的核营养素,如果实行SDS-PAGE阐述,核营养素条带在多种末期区域划分不光滑且相同(图1a)。随着核淀粉酶酶在多种备样中的表答现象,阐述显示同样条组备样的中个数近乎于同样条的水平(图1b),这说明力量备样核营养素享有好的的组内相同性和组间差异化性。 蛋清质组学共亲子技术监定出1996种蛋清质。以B0为参考组,筛分B1、B2、B4和B6中的蛋清开展异同形容解析,共亲子技术监定到376个DEPs。将火山图交互,并依据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05一个原则解析DEP。然而体现 如下图1c-f如下图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别亲子技术监定出22、33、73和140个DEPs,在这当中分发型别上浮6、11、32和87个,调整16、22、41和5多个。聚类算法工艺考评了不一样冷冻冷藏阶段性全身腹肌组建中蛋清质的形容,然而体现 体现 全身腹肌蛋清形容异同随存贮耗时的添加而添加(图1g)。
图1| 不一冰箱时段的健身肌肉备样胆固醇质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有相互影响保鲜冷库耗时的全身肌肉打样定制相互影响球蛋白概述(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身亡球蛋白肽的PRM酶联免疫法浅析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 研究背景KEGG聚集地域差异表示血清的铁消亡机理(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱怪物提供了TMT降钙素原检测营养素质组学技術性功能,拜谱海洋生物已的产品开发搞定并形成了改进早熟的转录组学、营养素组学、分泌组学或是几组学携手的产品技術性功能保障体系,欢迎致电咨询!
参考使用医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.